本劇講述1937年南京大屠殺的四十九日里發生的故事。日本軍隊進入淪陷的南京城，奉命掩埋中國死難士兵和戰俘尸體。與此同時，市中心的圣馬德倫教堂中迎來了一群不速之客，十來個女學生和秦淮河女子，她們殊途同歸只為同一件事――逃難。緊接著許多男人也因為各種原因進入了教堂。　　圍墻外的日軍尋找各種借口進入教堂，圣馬德倫教堂的后院成為他們填埋尸體掩蓋罪證的目標，國際安全區的組織者嘗試各種解救教堂被困人員的方案，卻屢屢失敗。　　教堂中的男人們為了保護藏在教堂閣樓和地窖中的女人，獻出了自己的生命，女人們或者選擇了有尊嚴地死去，或者進行了最壯烈的抵抗。　　在這四十九個日夜里，他們和他們，在一次次地求生、抵抗、毀滅和復活中締結了愛情、親情和友情，曾懦弱地變成了勇士、曾迷失的找到了方向、曾虛無的得到了收獲、曾有罪的完成了救贖。四十九日·祭劇照　　改編自嚴歌苓長篇小說《金陵十三釵》的電視劇《四十九日·祭》講述了南京被日軍攻占后，49日內發生的人間慘劇，反映了絕境中的生命意義與人性救贖。此外，在尊重原著基礎上，《四十九日》也有所創新：不再是兩個女性群體的命運互換，而是多個群體的逃生故事;外國的神無法救中國的人;亂世佳人情感碰撞;新加入的軍人形象更有熱血等。對此，導演張黎也曾表示說：“我們希望打撈歷史，在大悲劇中挖掘生命的本質，真實還原人性的選擇和情感力量。”宋佳飾演的玉墨(小宋佳 飾)在劇中沒有凋零，而是作為戰后幸存者參與了大屠殺清算;電影版的外國神父角色將由白玉蘭視帝張嘉譯 演出;新加入的軍人形象更有熱血，由胡歌 飾演的陸軍少尉戴濤(胡歌 飾)將與小宋佳 飾演的玉墨展開一段壓抑又凄美的感情故事。